마우스를 대상으로 한 조건부 유전자 표적화는 분자생물학 및 유전공학 분야에 혁명을 일으켰습니다. Cre-lox 시스템의 생체 내 응용은 매우 효율성이 높고 표적에 집중할 수 있으며 활용도가 높습니다. Cre-lox 시스템은 생체 내에서 유전자 기능을 조작하고 연구할 수 있도록 해주는 강력한 도구로, Cre 재조합 효소(Cre recombinase)를 사용하여 두 LoxP 부위 사이의 부위별 재조합을 유도합니다. 이 재조합 효소는 특정 세포 유형 또는 발달 단계에서 유전자를 활성화하거나 비활성화하는 중요한 분자 스위치 역할을 합니다.
Cre 재조합 효소(Cre recombinase) 는 LoxP 부위라고 하는 34-bp DNA 염기 서열을 인식하는 부위 특이적 재조합 효소입니다. Cre 매개 재조합은 중간 DNA 단편에 의해 분리된 동일한 방향의 두 LoxP 부위 사이에서만 발생합니다. Cre 매개 재조합을 통해 발생하는 결과는 두 LoxP 부위 사이의 DNA 단편의 절제, 반전 또는 전위입니다. Cre 매개 재조합의 효율성과 특이성은 Cre 효소의 농도, LoxP 부위의 방향 및 간격, 표적 DNA 서열의 염색질 맥락 등 여러 요인에 따라 달라집니다.
Cre-lox 기술을 활용하여 특정 세포 유형 또는 계통에서 Cre 매개 재조합을 유도하는 데 사용할 수 있는 광범위한 Cre 발현 마우스를 생성했습니다. 이러한 Cre driver line은 Cre line이라고도 불리며 현재 연구자들이 널리 활용할 수 있습니다. Cre line은 내인성 유전자 유전자좌에 Cre 인코딩 DNA 서열을 삽입하거나 특정 프로모터의 제어하에 Cre 효소를 발현하는 형질 전환 접근 방식을 사용하여 생성됩니다. 신경세포, 심근세포, 간세포, 면역세포 등 다양한 세포 유형에 대한 Cre line이 개발되었습니다.
Cre-lox 시스템이 가장 일반적으로 활용되는 응용 분야 중 하나는 상동 재조합을 통해 마우스의 게놈에 LoxP 부위를 삽입하는 gene floxing입니다. LoxP 부위는 표적 유전자 또는 DNA 단편의 측면에 위치하며, Cre 매개 재조합 시 플록싱된 유전자의 선택적 결실을 허용합니다. 이 접근 방식은 조건부 녹아웃(conditional knockout)으로 알려져 있으며, 이를 통해 특정 세포 유형 또는 발달 단계에서 유전자를 표적으로 삼아 비활성화할 수 있습니다. 조건부 녹아웃(conditional knockout)은 특정 세포 유형 또는 조직에 대한 유전자 삭제의 영향을 평가할 수 있기 때문에 생체 내 유전자 기능을 연구하는 데 유용한 도구입니다.
Cre-lox 시스템의 또 다른 응용 분야는 조건부 유전자 발현(conditional gene expression) 및 유도성 유전자 발현(inducible gene expression)으로, 이를 통해 외부 자극에 반응하거나 특정 발달 단계에 따라 유전자를 활성화할 수 있습니다. 이 기술은 독성이 있거나 배아에 치명적이거나 정상 발달에 필수적인 유전자의 발현을 제어하는 데 자주 사용됩니다. 유도성 유전자 발현(inducible gene expression)은 테트라사이클린 유도 시스템, 에스트로겐 수용체 융합 단백질 시스템, Cre-ERT2 시스템 등 여러 가지 접근 방식을 사용하여 달성할 수 있습니다. Cre-ERT2 시스템은 Cre와 변이된 에스트로겐 수용체 리간드 결합 도메인의 융합 단백질을 사용하여 타목시펜(tamoxifen) 또는 그 유도체에 의한 Cre 매개 재조합을 제어할 수 있습니다.
요약하면, Cre-lox 시스템은 유전공학 및 생체 내 유전자 기능 분석에 활용할 수 있는 강력한 도구입니다. Cre 재조합 효소(Cre recombinase)는 LoxP 부위 간의 부위별 재조합을 매개하는 핵심 효소입니다. Cre line은 특정 세포 유형 또는 계통에서 Cre 매개 재조합을 유도할 수 있도록 해줍니다. Gene floxing, 조건부 유전자 발현(conditional gene expression) 및 유도성 유전자 발현(inducible gene expression)은 생물의학 연구에서 널리 활용되는 Cre-lox 시스템의 생체 내 응용 분야 중 하나입니다. Cre-lox 시스템은 조건부 및 유도성 유전자 녹아웃 및 녹인 마우스 모델과 랫트(rat)의 세포 특이적 유전자 발현 시스템을 생성하는 데도 활용되었습니다. 연구자들은 이처럼 활용도가 높은 기술을 통해, 생체 내 유전자 기능을 보다 효과적으로 연구하고 유전 질환과 발달 생물학의 비밀을 풀 수 있게 되었습니다.
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